Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OXSMQ9NWU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OXSMQ9NWU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OXSMQ9NWU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OXSMQ9NWU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OXSMQ9NWU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OXSMQ9NWU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OXSMQ9NWU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OXSMQ9NWU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXSMQ9NWU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms