Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FBXO28Q9NVF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FBXO28Q9NVF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FBXO28Q9NVF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FBXO28Q9NVF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FBXO28Q9NVF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO28Q9NVF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO28Q9NVF7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms