Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTU7

CBLN4, Cerebellin-4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4Q9NTU7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLN4Q9NTU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN4Q9NTU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN4Q9NTU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBLN4Q9NTU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN4Q9NTU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1267.4 ms