Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
EMILIN3Q9NT22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN3Q9NT22 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EMILIN3Q9NT22 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN3Q9NT22 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EMILIN3Q9NT22 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EMILIN3Q9NT22 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EMILIN3Q9NT22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EMILIN3Q9NT22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms