Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBQLN4Q9NRR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBQLN4Q9NRR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBQLN4Q9NRR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN4Q9NRR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.9 ms