Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS4Q9NQG7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS4Q9NQG7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS4Q9NQG7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS4Q9NQG7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS4Q9NQG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS4Q9NQG7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms