Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE2Q9NQ36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE2Q9NQ36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCUBE2Q9NQ36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCUBE2Q9NQ36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCUBE2Q9NQ36 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCUBE2Q9NQ36 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms