Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC40A1Q9NP59 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC40A1Q9NP59 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC40A1Q9NP59 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC40A1Q9NP59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC40A1Q9NP59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms