Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR41Q9HAD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR41Q9HAD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR41Q9HAD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR41Q9HAD4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms