Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIF1Q9H611 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIF1Q9H611 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIF1Q9H611 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms