Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM12Q9H4Q4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM12Q9H4Q4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM12Q9H4Q4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM12Q9H4Q4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM12Q9H4Q4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM12Q9H4Q4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms