Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM117Q9H0C3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM117Q9H0C3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM117Q9H0C3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM117Q9H0C3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM117Q9H0C3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms