Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC5A7Q9GZV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC5A7Q9GZV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A7Q9GZV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC5A7Q9GZV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A7Q9GZV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms