Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL1Q9BYD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL1Q9BYD6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL1Q9BYD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms