Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM62Q9BVG3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM62Q9BVG3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM62Q9BVG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM62Q9BVG3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM62Q9BVG3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms