Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDHD3Q9BSH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms