Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMCHL2Q9BQD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMCHL2Q9BQD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PMCHL2Q9BQD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms