Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL4Q9BPW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOL4Q9BPW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOL4Q9BPW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL4Q9BPW4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms