Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PIK3R4Q99570 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
PIK3R4Q99570 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PIK3R4Q99570 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PIK3R4Q99570 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PIK3R4Q99570 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PIK3R4Q99570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms