Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY1Q96T51 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY1Q96T51 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY1Q96T51 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY1Q96T51 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms