Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RUFY1Q96T51 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RUFY1Q96T51 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RUFY1Q96T51 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RUFY1Q96T51 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUFY1Q96T51 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
RUFY1Q96T51 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RUFY1Q96T51 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RUFY1Q96T51 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RUFY1Q96T51 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RUFY1Q96T51 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RUFY1Q96T51 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RUFY1Q96T51 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RUFY1Q96T51 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RUFY1Q96T51 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RUFY1Q96T51 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RUFY1Q96T51 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RUFY1Q96T51 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RUFY1Q96T51 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RUFY1Q96T51 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RUFY1Q96T51 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RUFY1Q96T51 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RUFY1Q96T51 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RUFY1Q96T51 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RUFY1Q96T51 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUFY1Q96T51 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUFY1Q96T51 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUFY1Q96T51 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RUFY1Q96T51 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RUFY1Q96T51 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUFY1Q96T51 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RUFY1Q96T51 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RUFY1Q96T51 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RUFY1Q96T51 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RUFY1Q96T51 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUFY1Q96T51 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUFY1Q96T51 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RUFY1Q96T51 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RUFY1Q96T51 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUFY1Q96T51 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUFY1Q96T51 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUFY1Q96T51 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUFY1Q96T51 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUFY1Q96T51 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUFY1Q96T51 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RUFY1Q96T51 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUFY1Q96T51 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RUFY1Q96T51 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUFY1Q96T51 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUFY1Q96T51 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUFY1Q96T51 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUFY1Q96T51 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY1Q96T51 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY1Q96T51 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY1Q96T51 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUFY1Q96T51 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUFY1Q96T51 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUFY1Q96T51 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUFY1Q96T51 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUFY1Q96T51 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUFY1Q96T51 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RUFY1Q96T51 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUFY1Q96T51 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUFY1Q96T51 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUFY1Q96T51 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUFY1Q96T51 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RUFY1Q96T51 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUFY1Q96T51 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUFY1Q96T51 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUFY1Q96T51 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUFY1Q96T51 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUFY1Q96T51 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUFY1Q96T51 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY1Q96T51 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY1Q96T51 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY1Q96T51 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY1Q96T51 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY1Q96T51 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY1Q96T51 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUFY1Q96T51 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUFY1Q96T51 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY1Q96T51 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY1Q96T51 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY1Q96T51 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms