Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC4A9Q96Q91 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC4A9Q96Q91 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC4A9Q96Q91 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC4A9Q96Q91 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC4A9Q96Q91 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLC4A9Q96Q91 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC4A9Q96Q91 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLC4A9Q96Q91 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SLC4A9Q96Q91 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC4A9Q96Q91 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms