Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NECTIN4Q96NY8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN4Q96NY8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NECTIN4Q96NY8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NECTIN4Q96NY8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN4Q96NY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECTIN4Q96NY8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECTIN4Q96NY8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms