Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM3Q96MX0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM3Q96MX0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMTM3Q96MX0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM3Q96MX0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM3Q96MX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms