Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms