Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP2Q96F07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYFIP2Q96F07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP2Q96F07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP2Q96F07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP2Q96F07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP2Q96F07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms