Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALSU1Q96EH3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MALSU1Q96EH3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MALSU1Q96EH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MALSU1Q96EH3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms