Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC5Q96DU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC5Q96DU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PABPC5Q96DU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC5Q96DU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC5Q96DU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms