Protein–RNA interactions for Protein: Q96DR5

BPIFA2, BPI fold-containing family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA2Q96DR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA2Q96DR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA2Q96DR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA2Q96DR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA2Q96DR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA2Q96DR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA2Q96DR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA2Q96DR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA2Q96DR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms