Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMAQ96B86 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGMAQ96B86 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMAQ96B86 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMAQ96B86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMAQ96B86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMAQ96B86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms