Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H4Q92791 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H4Q92791 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3H4Q92791 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
P3H4Q92791 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms