Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC2Q92769 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC2Q92769 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC2Q92769 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC2Q92769 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms