Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUBCNQ92622 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RUBCNQ92622 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RUBCNQ92622 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUBCNQ92622 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUBCNQ92622 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUBCNQ92622 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RUBCNQ92622 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUBCNQ92622 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RUBCNQ92622 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RUBCNQ92622 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUBCNQ92622 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUBCNQ92622 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUBCNQ92622 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUBCNQ92622 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNQ92622 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNQ92622 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNQ92622 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNQ92622 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUBCNQ92622 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUBCNQ92622 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RUBCNQ92622 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUBCNQ92622 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms