Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN4Q92575 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN4Q92575 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN4Q92575 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN4Q92575 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN4Q92575 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN4Q92575 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN4Q92575 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN4Q92575 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN4Q92575 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN4Q92575 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBXN4Q92575 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN4Q92575 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN4Q92575 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN4Q92575 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN4Q92575 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.51■■■□□ 2
UBXN4Q92575 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBXN4Q92575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN4Q92575 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN4Q92575 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms