Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A3Q8WWT9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC13A3Q8WWT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A3Q8WWT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A3Q8WWT9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A3Q8WWT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC13A3Q8WWT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3Q8WWT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms