Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMBQ8TAX9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMBQ8TAX9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMBQ8TAX9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMBQ8TAX9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMBQ8TAX9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMBQ8TAX9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms