Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS3

MFSD8, Major facilitator superfamily domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD8Q8NHS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD8Q8NHS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD8Q8NHS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD8Q8NHS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD8Q8NHS3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD8Q8NHS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD8Q8NHS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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