Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER1Q8NEC5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CATSPER1Q8NEC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CATSPER1Q8NEC5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms