Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHDHQ8NE62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHDHQ8NE62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CHDHQ8NE62 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHDHQ8NE62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms