Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD1Q8NB12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD1Q8NB12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD1Q8NB12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD1Q8NB12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms