Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf62Q8N4C0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C9orf62Q8N4C0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf62Q8N4C0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf62Q8N4C0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms