Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8N402 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8N402 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8N402 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8N402 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8N402 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8N402 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8N402 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8N402 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8N402 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8N402 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8N402 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8N402 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8N402 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8N402 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8N402 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8N402 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8N402 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8N402 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8N402 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8N402 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8N402 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8N402 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8N402 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8N402 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8N402 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8N402 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8N402 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8N402 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8N402 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8N402 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8N402 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8N402 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8N402 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8N402 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8N402 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8N402 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8N402 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8N402 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8N402 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8N402 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8N402 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8N402 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8N402 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8N402 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8N402 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8N402 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8N402 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8N402 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8N402 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8N402 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8N402 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8N402 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8N402 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8N402 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8N402 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8N402 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8N402 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8N402 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8N402 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8N402 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8N402 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8N402 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8N402 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8N402 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N402 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N402 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N402 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N402 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N402 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N402 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N402 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N402 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms