Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC65Q8IXS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC65Q8IXS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC65Q8IXS2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC65Q8IXS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC65Q8IXS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC65Q8IXS2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC65Q8IXS2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms