Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 38
PHF6Q8IWS0 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)27.91■■■□□ 2.065e-7■■■■■ 37.5
PHF6Q8IWS0 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 327.11■■□□□ 1.935e-7■■■■■ 37.5
PHF6Q8IWS0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 37.5
PHF6Q8IWS0 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.267e-15■■■■■ 37.4
PHF6Q8IWS0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 37.1
PHF6Q8IWS0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 36.8
PHF6Q8IWS0 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 36.8
PHF6Q8IWS0 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.11e-40■■■■■ 36.7
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 36.6
PHF6Q8IWS0 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 318.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 36.6
PHF6Q8IWS0 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 36.6
PHF6Q8IWS0 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 36.5
PHF6Q8IWS0 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 36.5
PHF6Q8IWS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.334e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 528.95■■■□□ 2.224e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 228.77■■■□□ 2.24e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.094e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.944e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 ATP8B2-203ENST00000368490 473 ntTSL 326.42■■□□□ 1.824e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 226.06■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 426.06■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.464e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 223.83■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 323.4■■□□□ 1.344e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)23.23■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)23.23■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 523.18■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 323.11■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 223.01■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 522.84■■□□□ 1.254e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 422.25■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 522.25■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 321.66■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 420.77■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.84e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 519.91■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-202ENST00000417475 992 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 219.05■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 518.97■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-205ENST00000463125 835 ntTSL 218.84■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 218.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-206ENST00000476870 1750 ntTSL 218.45■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 418.09■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-204ENST00000437505 875 ntTSL 317.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 517.34■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIP6-203ENST00000429658 646 ntTSL 317.26■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.81■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 316.5■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 516.15■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 316.1■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 316.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 415.85■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 415.19■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.07■□□□□ 04e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 215.02□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt14.67□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 514.49□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 313.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 213.21□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 413.2□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 36.3
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