Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDSS2Q86YH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDSS2Q86YH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDSS2Q86YH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms