Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D4Q7Z3S7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms