Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK10Q6ZWH5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK10Q6ZWH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK10Q6ZWH5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK10Q6ZWH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK10Q6ZWH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK10Q6ZWH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK10Q6ZWH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK10Q6ZWH5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEK10Q6ZWH5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK10Q6ZWH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms