Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEM1Q6ZVN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEM1Q6ZVN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEM1Q6ZVN7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEM1Q6ZVN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEM1Q6ZVN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms