Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00173Q6ZV60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00173Q6ZV60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00173Q6ZV60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms