Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNI2Q6ZMN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNI2Q6ZMN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNI2Q6ZMN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNI2Q6ZMN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms