Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCBE1Q6UXH8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCBE1Q6UXH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCBE1Q6UXH8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCBE1Q6UXH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms